Sau một thời gian sử dụng, nhiều chủ xe Honda HR-V đã chỉ ra một số hạn chế phổ biến. Đây chủ yếu là những điểm yếu liên quan đến trải nghiệm vận hành và tiện nghi, thay vì các lỗi nghiêm trọng về độ bền hay an toàn.

Khả năng cách âm là điểm trừ quen thuộc trên nhiều mẫu xe phổ thông của Honda và HR-V cũng không ngoại lệ. Khi di chuyển trong đô thị, nhược điểm này không quá rõ ràng. Tuy nhiên, ở tốc độ cao hoặc trên mặt đường xấu, tiếng ồn từ lốp và gầm xe truyền vào cabin khá rõ. Điều này khiến người dùng thường xuyên đi xa dễ cảm thấy mệt mỏi và phải tốn thêm chi phí cải thiện cách âm.

Sử dụng hộp số vô cấp CVT giúp xe vận hành mượt và tiết kiệm nhiên liệu, nhưng lại bộc lộ hạn chế khi cần tăng tốc nhanh. Khi đạp sâu chân ga, vòng tua máy tăng cao gây ra tiếng "gào" rõ rệt, trong khi tốc độ không tăng tương xứng. Điều này có thể khiến những người quen xe số tự động truyền thống cảm thấy khó chịu.

Định hướng thể thao khiến HR-V được tinh chỉnh hệ thống treo theo hướng cứng, kết hợp với treo sau dạng dầm xoắn. Vì vậy, khi đi qua ổ gà, gờ giảm tốc hoặc đường xấu, xe phản hồi khá rõ, đặc biệt ở hàng ghế sau. Đây là điểm cần cân nhắc với gia đình có người lớn tuổi hoặc trẻ nhỏ.

Trong điều kiện nắng nóng, hệ thống điều hòa của HR-V bị đánh giá là làm mát chưa nhanh và chưa sâu so với một số đối thủ. Người dùng thường phải tăng tốc độ quạt lên cao để đạt độ mát mong muốn, dẫn đến tăng tiếng ồn và giảm sự dễ chịu trong cabin.

Một số chủ xe phản ánh màn hình trung tâm có hiện tượng giật, lag hoặc phản hồi chậm. Đặc biệt, kết nối Apple CarPlay và Android Auto đôi khi bị gián đoạn, gây bất tiện khi sử dụng bản đồ hoặc giải trí. Dù có thể khắc phục bằng cập nhật phần mềm, đây vẫn là điểm trừ với nhóm khách hàng trẻ.

Nhìn chung, các hạn chế của Honda HR-V chủ yếu xuất phát từ triết lý thiết kế thiên về cảm giác lái và độ ổn định, thay vì tối ưu sự êm ái. Mẫu SUV này vẫn phù hợp với những người ưu tiên độ bền, thương hiệu Nhật và khả năng vận hành chắc chắn. Tuy nhiên, với khách hàng đề cao sự yên tĩnh, tiện nghi và trải nghiệm mượt mà, việc lái thử và cân nhắc kỹ trước khi quyết định là điều cần thiết.