Huyện Yên Định (Thanh Hóa) và Trại giam số 5 đã huy động hơn 500 người và phương tiện xe, máy di chuyển hơn 300 con lợn còn sống đến nơi an toàn.  Đối với 4000 con lợn bị chết, các lực lượng đã phải tháo mái trang trại để thông hơi và phun hóa chất khử mùi, khử độc, sau đó mới có thể cho người vào vận chuyển xác lợn đi tiêu hủy. Do khu vực trang trại vẫn bị ngập sâu nên lực lượng chức năng phải dùng xuồng máy, bè mảng để vận chuyển lợn ra ngoài .

Do số lợn chết quá lớn, đã bị phân hủy trong khi vẫn còn bị ngập, khu vực chôn lấp ở xa nên việc tiêu hủy rất khó khăn. Huyện Yên Định và Trại giam số 5 đang nỗ lực ở mức cao nhất, vận chuyển xác lợn đến đâu tiêu hủy đến đó và xử lý môi trường theo quy trình.