Các đợt mưa lớn gây lũ của năm 2016 và 2017 đã làm phá vỡ phần kết cấu bê tông cuối sân tiêu năng tràn xả lũ với diện tích gần 1000 m2, chiều dài xói lở là trên 20m, rộng 30m và tạo ra nhiều hàm ếch trên đập thuỷ lợi Nam Thạch Hãn.

Hiện trạng hố tiêu năng đang xói sâu hơn, với độ sâu từ 7 đến 9m. Nếu công trình tràn xả lũ Nam Thạch Hãn bị vỡ sẽ làm ảnh hưởng nghiêm trọng tới việc tưới cho 15.000 ha lúa của đồng bằng Triệu Hải, chiếm hơn 50% diện tích lúa của toàn tỉnh Quảng Trị và hàng trăm ha nuôi trồng thủy sản bị nhiễm mặn. Đặc biệt là không thể cung cấp nước sạch cho 86.000 dân của thị xã Quảng Trị.

Tỉnh Quảng Trị cũng đã trích hơn 14 tỷ đồng từ nguồn vốn khắc phục lụt bão để khoan phụt chống thấm và gia cố nền, gia cố phần bê tông dốc nước và gia cố hố xói nhằm hạn chế hố xói sân tiêu năng, nhưng đây chỉ là giải pháp tạm thời.

Tại hội thảo các chuyên gia đầu ngành về thủy lợi đã chỉ ra tính cấp bách của công trình Nam Thạch Hãn nếu không kịp thời xử lý thì hậu quả khôn lường đối với vùng hạ du do nguy cơ vỡ đập. Theo ngành nông nghiệp Quảng Trị cho biết, để xử lý triệt để công trình Nam Thạch Hãn phải cần có trên 84 tỷ đồng, nhưng nguồn lực của địa phương chưa thể đáp ứng được .