Cả nông dân lẫn các cơ quan quản lý đều cho rằng: kiểm soát chất lượng phân bón, thuốc bảo vệ thực vật thực sự là điều vô cùng khó khăn. Một trong các nguyên nhân là thị trường phân bón, thuốc trừ sâu phong phú, đa dạng đến mức nhiễu loạn chủng loại mặt hàng. Nhiều nông dân thừa nhận, đầu vụ sản xuất như hiện nay, đến bất kỳ cửa hàng phân bón, thuốc bảo vệ thực vật nào cũng khó tránh khỏi hoa mắt trước quá nhiều mặt hàng phân bón, thuốc bảo vệ thực vật.

Phân bón giả hay thật? Thuốc trừ sâu tốt hay kém chất lượng? Câu trả lời chỉ có sau khi nông dân đã sử dụng và cho kết quả trên ruộng vườn. Nhưng những lúc như thế này, có nhận ra sản phẩm kém chất lượng thì cũng đã là muộn. Trên 3500 tên thương mại thuốc bảo vệ thực vật và không dưới 6 ngàn sản phẩm phân bón. Đây chỉ mới là con số thống kê, còn trong thực tế chắc chắn nhiều hơn. Chỉ riêng điều này đã đủ thấy việc quản lý thị trường phân bón, thuốc bảo vệ thực vật là điều không hề dễ dàng. Hơn nữa, số lượng cơ sở kinh doanh mặt hàng này chỉ riêng một địa phương như tỉnh Phú Yên đã lên đến con số 600 cơ sở.

Việc quản lý mặt hàng phân bón, thuốc bảo vệ thực vật được tăng cường vào thời điểm đầu vụ sản xuất như hiện nay. Tuy nhiên, không ít nông dân buộc chấp nhận thực tế: rất có thể phân bón, thuốc bảo vệ thực vật mua về chẳng mấy tác dụng, nhưng nông dân lại chẳng dám phản hồi bởi đa phần đều mua nợ các đại lý.