Vườn quốc gia có tổng diện tích 21.107 ha, là loại rừng với hệ sinh thái rừng nhiệt đới ngập nước thuộc loại rất hiếm trên thế giới. Hệ thống động thực vật tại đây rất đa dạng và phong phú, thuộc vào bậc nhất ở khu vực Đồng bằng sông Cửu Long với 32 loài thú, 186 loài chim, 39 loài bò sát lưỡng cư, 34 loài cá… Nhiều loài động vật được ghi trong sách đỏ Việt Nam và thế giới.
‘ Vườn quốc gia U Minh Thượng. (Ảnh: Sài Gòn giải phóng)
Vườn quốc gia U Minh Thượng là vườn quốc gia thứ 5 của Việt Nam được công nhận là Vườn Di sản ASEAN, cũng là Vườn di sản trên đất than bùn đầu tiên của khu vực. Bốn vườn quốc gia khác của Việt Nam được công nhận là Vườn Di sản ASEAN gồm Vườn quốc gia Hoàng Liên (Lào Cai), Ba Bể (Bắc Kạn), Chư Mom Ray (Kon Tum) và Kon Ka Kinh (Gia Lai).