Bước đầu, cơ quan điều tra xác định, khi xảy ra vụ nổ tại hiện trường có khoảng 500kg hóa chất - thành phần để sản xuất ra phân bón vô cơ. Tuy nhiên, thành phẩm chưa phân phối ra thị trường đã xảy ra cháy nổ.
Qua quá trình điều tra, khám nghiệm hiện trường, tổ công tác đưa ra nhận định ban đầu: 3 nữ công nhân có thể dùng bếp gas mini lấy nguồn nhiệt tạo màng co cho các chai phân vi sinh thành phẩm. Trong lúc làm việc, có thể do bất cẩn nhóm nữ công nhân để khí gas rò rỉ bén vào số hóa chất để gần đó gây cháy nổ.
Cơ quan công an cũng đã tiến hành làm việc với đại diện công ty để làm rõ một số vấn đề liên quan đến nguồn gốc, xuất xứ các loại hóa chất thu được tại hiện trường; phương án thẩm duyệt cháy nổ trong quá trình hoạt động công ty.
Vụ nổ khiến 1 nữ công nhân bị thương nặng và tử vong tại bệnh viện. 2 người bị mất tích và xác định đã tử vong. Hiện nguyên nhân chính thức của vụ nổ đang tiếp tục được điều tra.