Theo các cam kết song phương và đa phương đã được ký kết, trong vòng 10 năm, Việt Nam cam kết tự do hóa đối với 87,66% kim ngạch thương mại. Đổi lại, Nhật Bản cam kết tự do hóa 94,53%.
Nhật Bản tiếp tục là thị trường tiềm năng với nhiều khung pháp lý thuận lợi thúc đẩy cho thương mại giữa hai nước. Tuy nhiên, Nhật Bản có một hệ thống phân phối phức tạp, chi phí xúc tiến thương mại và điều tra thị trường cao, thị trường tiêu thụ trải dài trên hàng nghìn hòn đảo với quy mô và tập quán tiêu dùng khác nhau cũng là trở ngại cho doanh nghiệp Việt Nam khi tiếp cận thị trường này.