Năm 2013, qua kiểm tra 280.929 hồ sơ, Cục đã điều chỉnh 5.487 tỷ đồng tiền thuế. Đơn vị đã hoàn thành 6.252 cuộc thanh tra, kiểm tra với tổng số thuế truy thu, truy hoàn và xử phạt 1.924 tỷ đồng, giảm khấu trừ 240,7 tỷ đồng, giảm lỗ 2.037 tỷ đồng. Công tác quản lý nợ thuế thu được kết quả khả quan với tỷ lệ nợ thuế có khả năng thu tính đến cuối năm 2013 là 6.418 tỷ đồng…
Những kết quả này góp phần giúp thu ngân sách cả năm 2013 đạt 153.371 tỷ đồng, bằng 102,4% dự toán pháp lệnh, tăng 14,2% so với năm 2012. Năm 2014 được xác định là năm "Văn hóa - Kỷ cương" của ngành thuế Hà Nội. Cục Thuế TP Hà Nội sẽ tiếp tục triển khai các chính sách của Chính phủ nhằm tháo gỡ khó khăn cho DN, góp phần hỗ trợ sản xuất kinh doanh. Đơn vị sẽ tích cực cải cách thủ tục hành chính thuế nhằm tạo thuận lợi tối đa cho người dân thực hiện nghĩa vụ với ngân sách nhà nước.