Trong năm 2013, diện tích nuôi trồng thủy sản đạt 1,037 triệu ha, giảm 0,2% so với năm 2012; trong đó diện tích nuôi cá tra 10.000 ha, giảm 7,2%; diện tích nuôi tôm 637.000 ha, tăng 1,6%.
Diện tích nuôi tôm thẻ chân trắng có xu hướng phát triển mạnh thay cho nuôi tôm sú vì loại tôm thẻ chân trắng cho năng suất cao, thời gian nuôi ngắn và ít bị bệnh hơn. Năm 2013, diện tích thả nuôi tôm thẻ chân trắng là 65.200 ha, gấp gần 2 lần so với năm trước; sản lượng đạt 230.000 tấn, tăng 56,5%.
Sản lượng cá tra cả năm ước tính đạt 1,17 triệu tấn, giảm 6% so với năm 2012. Sản lượng cá tra giảm do sản xuất gặp khó khăn trong thời gian dài do giá bán cá tra nguyên liệu giảm trong khi giá chi phí đầu vào tăng. Tuy nhiên, nuôi cá tra đang có những chuyển dịch khá mạnh theo hướng tăng diện tích thả nuôi ở khu vực doanh nghiệp và giảm diện tích thả nuôi ở khu vực hộ gia đình.
Nuôi cá và các loài thủy sản khác phát triển mạnh, tập trung vào loài đặc sản có giá trị kinh tế cao, phục vụ nhu cầu tiêu dùng trong nước như: Cá diêu hồng, rô phi, trắm đen, cá sấu, ba ba, nghêu...
Thời tiết không thuận lợi, nhiều mưa bão, giá xăng dầu tăng cũng làm ảnh hưởng lớn đến hoạt động khai thác thủy sản. Tuy nhiên, được sự quan tâm, tạo điều kiện của chính quyền địa phương nên sản lượng thủy sản khai thác năm nay vẫn tăng, ước tính đạt 2,709 triệu tấn, tăng 3,3% so với năm trước, trong đó khai thác biển đạt 2,519 triệu tấn, tăng 3,5%. Sản lượng khai thác cá ngừ đại dương có xu hướng giảm nhiều, chỉ đạt 13.000 tấn, giảm 15% so với năm 2012, chủ yếu do chất lượng cá không đạt tiêu chuẩn xuất khẩu và giá tiêu thụ giảm mạnh.