Các doanh nghiệp sản xuất xăng sinh học đang chịu lỗ do phải đầu tư cải tạo, bổ sung thiết bị, cơ sở vật chất để phục vụ phân phối xăng E5 nhưng không được ưu đãi dự án sản xuất.
Cả nước hiện có khoảng 12.000 cửa hàng xăng dầu nhưng chỉ có 170 cửa hàng có bán xăng E5. Trong khi chờ lộ trình tiêu thụ xăng E5, các nhà máy sản xuất nhiên liệu sinh học thuộc Petrovietnam phải hoạt động cầm chừng, tìm hướng xuất khẩu phần lớn sản phẩm với chi phí cao, giá thành thấp.
Bộ Công Thương lo ngại, nếu tình trạng này kéo dài thì lộ trình áp dụng tỷ lệ phối trộn nhiên liệu sinh học với nhiên liệu truyền thống khó có thể thực hiện đúng thời gian quy định.