Riêng về quản lý giá thuốc, Chính phủ yêu cầu cần bảo đảm sự thống nhất, đồng bộ của dự thảo Luật Dược với Luật Giá, theo hướng Bộ Tài chính quản lý nhà nước tổng hợp về giá, hướng dẫn, thẩm định, kiểm tra việc xác định giá; còn Bộ Y tế quản lý nhà nước chuyên ngành về
giá thuốc, quy định cụ thể về giá thuốc.
Đồng thời, Luật cũng cần quy định nguyên tắc về thành lập và người đứng đầu hội đồng hoặc ủy ban liên ngành về quản lý giá thuốc, giao Thủ tướng quyết định tổ chức và hoạt động của hội đồng hoặc ủy ban này.