Theo VASEP, trong 236 đầu mối xuất khẩu cá tra hiện nay có 94 doanh nghiệp có nhà máy chế biến cá tra, chiếm đến 90% giá trị kim ngạch xuất khẩu ngành cá tra. Giá trị xuất khẩu cá tra của các doanh nghiệp không có nhà máy chế biến chỉ chiếm khoảng 10%.
Tuy nhiên, những doanh nghiệp không có nhà máy chế biến lại có xu hướng cơ hội, lợi dụng những lỗ hổng trong quản lý Nhà nước thu gom các nguồn cá kém phẩm chất, kém chất lượng sau đó, chế biến trong những điều kiện không đảm bảo, chào hàng cạnh tranh bằng giá thấp, gây tác động tiêu cực đến thị trường.
Do đó, VASEP kiến nghị Thủ tướng Chính phủ xem xét quy định điều kiện xuất khẩu cá tra là các doanh nghiệp có nhà máy chế biến đủ điều kiện chế biến thực phẩm, đáp ứng các quy định về truy xuất nguồn gốc.