Trong năm 2013, Việt Nam xuất sang thị trường Malaysia lượng hàng hóa trị giá 4,982 tỷ USD và nhập khẩu 4,133 tỷ USD, đạt xuất siêu 849 triệu USD. Đây là năm thứ hai liên tiếp trong hơn 20 năm qua Việt Nam xuất siêu sang thị trường này.
Các mặt hàng xuất khẩu chính của Việt Nam sang thị trường Malaysia trong năm ngoái bao gồm máy vi tính, sản phẩm điện tử và linh kiện, dầu thô, điện thoại các loại và linh kiện, cao su, gạo, sắt thép các loại, phương tiện vận tải và phụ tùng, thủy tinh và các sản phẩm từ thủy tinh.
Về đầu tư, Malaysia hiện đứng thứ 8 trong số các nước và vùng lãnh thổ đầu tư vào Việt Nam, với tổng vốn đầu tư đạt khoảng 10,2 tỷ USD năm 2013.