Thí sinh thi liên thông có quyền lợi như tất cả các thí sinh khác. Thí sinh được sử dụng kết quả thi liên thông để xét tuyển hệ chính quy hoặc liên thông cùng ngành tại các cơ sở đào tạo. Khi trúng tuyển và học liên thông thí sinh được Hội đồng đào tạo liên thông của cơ sở đào tạo xem xét, công nhận giá trị chuyển đổi kết quả học tập và khối lượng kiến thức được miễn trừ.
Thủ trưởng cơ sở đào tạo quyết định đào tạo liên thông từ tình độ Trung cấp chuyên nghiệp lên trình độ Cao đẳng hoặc từ trình độ Cao đẳng lên trình độ Đại học khi đáp ứng điều kiện quy định tại Điều 4 tại thông tư nêu trên.
Bộ trưởng Bộ GD-ĐT quyết định cho phép đào tạo liên thông từ trình độ Trung cấp chuyên nghiệp, Trung cấp nghề lên trình độ Đại học, từ trình độ Trung cấp nghề lên trình độ Cao đẳng, từ trình độ Cao đẳng nghề lên trình độ Đại học.
Thí sinh đăng kí đào tạo liên thông xem xét thông tin cụ thể được đăng tải trên website của các cơ sở đào tạo có đào tạo liên thông.